連合宇宙軍極東連隊を統括している部署。組織割の都合上大隊扱いとなっている。

ブルージャケット、ラボラトリと並ぶ連合宇宙軍極東連隊の一部署。極東連隊全体の統括と自治区内の行政を主に担当している大本営を中心とした部署で、地方自治区の統轄をしている地方弁務官団、軍内部の綱紀を守る軍警察機構（ホワイトジャケット）を内包する。

ちなみに欧州連隊では同ポジションの部署を「総統府」と呼ぶ為、基本的には「長官府」だけで極東連隊のそれと解釈される。

地方弁務官
ホワイトジャケット

全般的に枝葉が先にあって後から纏め上げた組織が連合宇宙軍特有の特徴だが、こと長官府においてはまず最初に司令部があり、その下に軍警察と地方弁務官を置いている為、ブルージャケットよりはスマートな指揮系統を持つ。しかし急激な組織の立て直しに伴い立場の上下が形骸化している為、随所で席次が逆転している現象はより顕著である。

統括本部（＝大本営）
┣人事部
┗内政部

弁務官管理課
沙渓市弁務官団
悠里市弁務官団